Root 권한 없이 Python 2.7.3, numpy 1.6.2, scipy 0.11.0, setuptools, pip 설치하기

  최근 사용하려는 클러스터에 Python 2.4가 설치되어 있더군요. 그리고 NumPy와 SciPy가 설치되어 있지 않았습니다. Root 권한이 없었기에 컴퓨터 전체에 설치하는 것이 힘들어 제 개인 계정에 설치하기로 했습니다. 이에 대한 허락은 관리자로부터 얘기하여 받았습니다.

  먼저 제가 참조하였던 페이지들의 링크를 올리겠습니다. 이것들을 보면 아마 제가 했던 것을 제대로 하실 수 있으실 것입니다. 제가 설치를 하여 완료한 곳은 CentOS release 5.6 (Final)입니다.

• http://gunheeleo.blogspot.kr/2010/04/python-install-numpy-and-scipy-without.html
• http://www.hongliangjie.com/2012/04/01/install-numpy-and-scipy-on-centos-without-root-privilege/
• http://mishuo.blogspot.kr/2012/07/how-to-install-numpy-and-scipy-in.html
• http://stackoverflow.com/questions/7465445/how-to-install-python-modules-without-root-access

  먼저 Python을 설치합니다.

1. http://www.python.org/download/ 페이지에 가서 Python 2.7.3 source 파일을 받습니다. (받는 방법은 wget 명령어를 이용하세요.)
2. 압축을 풉니다. (tar xvfz 옵션을 넣어주세요 with tgz 확장자)
3. 압축을 푼 디렉토리로 이동합니다. (cd 명령어를 이용하세요.)
4. make clean
5. ./configure –prefix=~/.local
   여기서 ~/의 의미는 자기 자신의 home directory를 의미합니다. 제 경우에는 /home/nosyu/입니다. 이는 제 아이디가 nosyu이기 때문입니다.
6. make
7. make install
8. 이제 python 실행을 쉽게 하기 위하여 PATH 환경변수에 해당 디렉토리를 추가합니다.
   vim ~/.bashrc
9. export PATH=$HOME/.local/bin:$PATH
   위의 것을 삽입합니다. Text file 편집에는 vim 외에 편하신 에디터를 사용하시면 되겠습니다.

  이제 Numpy를 설치합니다.

1. Numpy 설치에 필요한 LAPACK과 BLAS를 소스 파일을 다운로드 받습니다.
   LAPACK: http://www.netlib.org/lapack/
   BLAS: http://www.netlib.org/blas/
2. 다운로드 받은 파일의 압축을 풉니다.
   저의 경우 압축을 풀어서 생긴 directory의 절대 주소는 다음과 같았습니다.
   LAPACK: /home/nosyu/download/lapack-3.4.2
   BLAS: /home/nosyu/download/BLAS
   이는 후에 꼭 필요하기에 자신에게 맞는 주소를 확인합니다.
   확인하는 방법은 해당하는 directory에 가서 pwd 명령어를 입력하면 확인할 수 있습니다.
3. Numpy 소스 파일을 다운로드 받고 압축을 풉니다.
   http://sourceforge.net/projects/numpy/
4. site.cfg 파일을 만듭니다.
   이 때 site.cfg.example 파일을 사용하면 되기에 cp 명령어로 복사하는 것이 좋습니다.
   cp site.cfg.example site.cfg
5. site.cfg 파일을 수정합니다.
   vim site.cfg
6. 다음의 것을 입력합니다. 혹은 #으로 표시되어 주석 처리 되어 있는 것을 #을 없애는 방법으로 편하게 할 수 있습니다. 이것에 대해 잘 이해가 안 되면 그냥 밑에 것을 그대로 복사해서 붙여 넣으세요.
   [DEFAULT]
   src_dirs = /home/nosyu/download/BLAS/:/home/nosyu/download/lapack-3.4.2/
   [blas_opt]
   libraries = f77blas, cblas
   [lapack_opt]
   libraries = lapack, f77blas, cblas
1. 이 때 src_dirs 뒤에는 2번에서 확인한 LAPACK과 BLAS의 directory의 절대 주소를 넣어야 합니다. BLAS의 것 다음에 :을 넣고 LAPACK의 것을 넣습니다.
7. Python setup.py build –fcompiler=gnu95
8. python setup.py install –prefix=~/.local
   Iinstall을 할 때 설치한 Python의 위치를 알려줍니다.
9. 이후 설치가 완료되었다면 다른 directory로 이동한 후 python을 실행시켜 test해봅니다.
   import numpy
   numpy.test(‘full’)

  마지막으로 Scipy를 설치합니다.

1. Scipy 소스코드를 다운로드 받아서 압축을 풉니다.
   http://sourceforge.net/projects/scipy/files/
2. Numpy를 설치할 때 사용하였던 site.cfg 파일을 Scipy directory에 복사합니다.
3. Python setup.py build –fcompiler=gnu95
4. python setup.py install –prefix=~/.local
5. 이후 설치가 완료되었다면 다른 directory로 이동한 후 python을 실행시켜 test해봅니다.
   import scipy
   scipy.test(‘full’)
1. 제 경우에는 몇 가지 에러가 발생하더군요. 하지만 제가 짠 소스 코드에는 해당 모듈을 사용하지 않기에 신경쓰지 않았습니다.

  참고로 test를 할 때 nose가 없다는 메시지가 뜰 것입니다. 이를 해결하기 위해서는 nose 모듈을 설치하면 됩니다. 방법은 여러 가지가 있지만, easy_install 설치와 함께 얘기하겠습니다.

  Setuptools(easy_install) 설치

1. setuptools 파일을 다운로드 받는다.
   http://pypi.python.org/pypi/setuptools
1. 이 때 소스 파일이 아니라 egg 파일을 다운로드 받습니다. 저는 Python 2.7이기에 setuptools-0.6c11-py2.7.egg을 다운로드 받았습니다.
2. sh setuptools-0.6c11-py2.7.egg –prefix=~/.local/
3. 설치가 완료되었습니다. 참고로 저는 prefix 옵션을 넣지 않았습니다. 그래도 혹시 모르니 넣으시길 바랍니다.

  Python Package Index(pip) 설치

1. pip 소스코드를 다운로드 받아서 압축을 푼다.
   http://pypi.python.org/pypi/pip
2. 압축을 푼 directory에서 다음을 실행한다.
   python setup.py install –prefix=~/.local
3. 설치 완료

  pip 사용하여 nose 패키지 설치하기

1. pip install –user nose

  –user 옵션을 넣으면 거기에 맞춰서 자동으로 처리됩니다. 참고로 numpy나 scipy도 이렇게 pip를 설치한 후 설치를 시도하니 되기는 됩니다. 하지만 무언가 이상한 것 같아 위의 방법을 사용하였습니다.

  이 문서는 제가 훗날 필요할 것이라 가정하여 작성하였습니다.